С 1964 живёт в Ереване, а с 1970 работает на киностудии «Арменфильм» в качестве художника-мультипликатора, а с 1972 — режиссёра-мультипликатора. Является также автором сценариев и художником-постановщиком практически всех своих фильмов, которых около тридцати (10- и 30-минутных) и клипов для канала ОРТ и армянского телевидения (около 70), а также соавтором других анимационных фильмов, снятых на киностудии «Арменфильм». Фильмы имеют награды международных и всесоюзных кинофестивалей во Франции, Италии, Испании, Германии, Японии, а также в странах бывшего СССР — Киеве, Ереване, Москве, Таллине.

В 1987 получил звание Заслуженного деятеля искусств. Является художественным руководителем объединения мультипликационных фильмов киностудии «Арменфильм». Некоторые фильмы Саакянца сняты по сказкам классика армянской литературы Ованеса Туманяна. В 1992 сотрудничал со студиями «Кристмас Филмз» и «Союзмультфильм». Член АСИФА.

В 2002 результате знакомства Роберт Саакянца с творческой группой, названной впоследствии Yellow Submaryan, появилась на свет серия уникальных рисованных клипов Yellow Submaryan. Он также является режиссёром обучающих мультфильмов для детей (2004, 2007, 2008